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根据本周《自然-生态与演化》在线发表的一篇论文Partial genomic survival of cave bears in living brown bears，虽然洞熊在2.5万年前已经灭绝，但是它们的DNA依然存在于今天的棕熊体内。
棕熊的基因组中可能携带洞熊的DNA片段。德国波茨坦大学的Axel Barlow及同事分析了4只生活在71，000年–34，000年前的洞熊的基因组序列，并将其与其它动物的DNA和基因组序列进行比较，包括古代及现代棕熊、北美和亚洲黑熊、眼镜熊、熊猫和北极熊，之前有研究发现北极熊和棕熊曾杂交。
左：洞熊经常在冬眠期间死亡，使得其冬眠的洞穴中充满了数百只洞熊的骨头（Andrei Posmoșanu）；右：冰河时代在洞熊冬眠洞穴中发现的骨头（ Marius Robu ）。作者发现他们测序的所有棕熊基因组都包含洞熊DNA——占比为基因组的0.9–2.4%，而洞熊也包含一些棕熊DNA，不过占比较低。作者总结表示，在洞熊灭绝之前，棕熊和洞熊一定发生了杂交。进一步的DNA分析发现，在这两个物种之间存在基因流动。
洞熊在其冬眠的洞穴中留下了抓痕。虽然已知现代非洲以外的人类包含少量已灭绝的古人类（如尼安德特人与丹尼索瓦人）的DNA，但是在人类谱系之外的现存种群内，发现冰河时代已灭绝物种的DNA尚属首次。
左：古DNA研究人员收集洞熊骨骼进行遗传分析（ Viorel Lascu ）；右：在古DNA实验室处理古代样品（Karla Fritze ）。